In einer postapokalyptischen Zukunft hat die Welt eine Pandemie heimgesucht, Die Seuche hat beinahe die gesamte Menschheit ausgelöscht und die Überlebenden sind in einer ausweglosen Situation. Sie wollen versuchen, die Ereignisse rückgängig zu machen und entsenden dafür James Cole (Aaron Stanford) in die Zeit vor der Apokalypse. Er soll die Ursache der Katastrophe finden und eliminieren.

Diese Serie ist eine Adaption des Films „12 Monkeys” mit Bruce Willis und Brad Pitt aus dem Jahr 1995.