J.D. (Zach Braff) und sein bester Freud Turk (Donald Faison) kommen frisch von der Uni an das Sacred Heart Krankenhaus, wo sie nun als Assistenzärzte arbeiten sollen. Sie lernen bald den Ernst des Krankenhausalltags mit all seinen Herausforderungen kennen. Abgesehen von medizinischen Fällen müssen sie sich nämlich mit ihrem bösartigen Chef und dem gemeinen Hausmeister auseinandersetzen. Und dazu kommen noch private Themen rund um Freundschaft und Liebe.

Abseits der gewöhnlichen Krankenhausserien ist Scrubs mehr komisch als dramatisch und begleitet die jungen Ärzte bei ihren ersten Gehversuchen inkl. Ausrutschern.